Notice
Estimation rapide des populations microbiennes dans des échantillons de poisson par analyse RFLP de l'ADNr 16S
Rapid estimation of microbial populations in fish samples by using terminal restriction fragment length polymorphism analysis of 16S rDNA
Tanaka Y., Takahashi H. , Kitazawa N., Kimura * B.
* Department of Food Science and Technology, Faculty of Marine Science, Tokyo University of Marine Science and Technology, Tokyo 108-8477, Japan ; Tél.: +81.3.5463.0603 ; Fax : +81.3-5463.0603 ; E-mail : kimubo@kaiyodai.ac.jp
Journal of Food Protection, 2010, Vol. 73 (1), p. 104-113 - Texte en Anglais
à commander à : l'auteur, l'éditeur ou à l'INIST
Résumé
Un système rapide d'analyse du polymorphisme de longueur des fragments terminaux de restriction (T-RFLP) ciblant l'ARN 16S est décrit pour étudier les populations microbiennes d'échantillons de poisson. La base de données des fragments de restriction a été construite en collectant 102 souches de bactéries représentant 53 genres associés au poisson. La digestion de l'ARN 16S de ces 102 souches avec deux enzymes de restriction, HhaI et MspI, a abouti à 54 profils permettant une discrimination au niveau du genre.
Ce système T-RFLP a produit des résultats comparables à ceux d'une méthode culturale sur 6 échantillons de poisson avec une correspondance de 71,4 à 92,3 %. L'utilisation de ce système a permis une estimation de la population microbienne en 7 h. Une analyse rapide de la population microbienne présente des avantages pour les industriels et les laboratoires de contrôle ; de plus, la stratégie présentée ici permet de s'adapter à des applications spécifiques.
Imprimer
Résumé au format pdf